Results on a set of 155 Transmembrane proteins

C_indices for individual predictions and joint prediction (CoPreTHi)

ID AC Code DAS PredTMR TopPred PHD SOSUI TmPred CoPreTHi
N3D_1PRCH Test1A 0.75 0.85 0.95 0.91 0.92 0.97 0.92
N3D_1PRCL Test1B 0.72 0.76 0.81 0.85 0.78 0.79 0.83
N3D_1PRCM Test1C 0.79 0.76 0.68 0.88 0.80 0.79 0.90
4F2_HUMAN P08195 0.71 1.00 0.61 0.99 1.00 0.57 0.98
5H1A_HUMAN P08908 0.79 0.77 0.80 0.84 0.81 0.93 0.89
5H2A_CRIGR P18599 0.80 0.83 0.76 0.86 0.81 0.91 0.89
5HT3_HUMAN P46098 0.66 0.90 0.80 0.79 0.56 0.62 0.75
5HT3_MOUSE P23979 0.66 0.84 0.80 0.80 0.66 0.63 0.72
A15_HUMAN P41732 0.74 0.85 0.77 0.88 0.67 0.90 0.87
A1AA_HUMAN P35348 0.80 0.70 0.82 0.85 0.91 0.79 0.85
A2AA_HUMAN P08913 0.80 0.84 0.81 0.83 0.89 0.89 0.90
A4_HUMAN P05067 0.64 0.96 0.65 0.86 0.49 0.72 0.72
AA1R_CANFA P11616 0.77 0.81 0.78 -0.20 0.76 0.79 0.87
AA2A_CANFA P11617 0.80 0.64 0.73 0.87 0.86 0.91 0.86
ADT_RICPR P19568 0.65 0.73 0.77 0.69 0.64 0.68 0.78
ALKB_PSEOL P12691 0.69 0.72 0.81 0.63 0.76 0.62 0.83
ATPL_ECOLI P00844 0.97 0.82 0.69 0.85 0.90 0.77 0.95
BAC1_HALS1 P19585 0.77 0.73 0.76 0.82 0.83 0.60 0.88
BACH_HALHM P33970 0.41 0.44 0.15 0.46 0.40 0.53 0.56
BACH_HALSS P33742 0.56 0.58 0.53 0.66 0.47 0.68 0.72
BACR_HALHA P02945 0.72 0.77 0.85 0.83 0.76 0.83 0.92
C561_BOVIN P10897 0.77 0.83 0.58 0.77 0.87 0.88 0.85
CB21_PEA P04159 0.72 0.77 0.90 0.71 0.51 0.93 0.82
CD37_HUMAN P11049 0.81 0.83 0.80 0.79 0.67 0.87 0.87
CD53_HUMAN P19397 0.87 0.82 0.77 0.80 0.78 0.89 0.88
CD63_HUMAN P08962 0.85 0.88 0.78 0.85 0.88 0.89 0.90
CD63_RAT P28648 0.86 0.88 0.78 0.87 0.84 0.87 0.92
CD81_HUMAN P18582 0.87 0.88 0.63 0.86 0.89 0.93 0.92
CD82_HUMAN P27701 0.87 0.78 0.75 0.88 0.87 0.91 0.89
CD9_CERAE P30409 0.89 0.72 0.77 0.82 0.81 0.88 0.86
CD9_FELCA P40239 0.89 0.72 0.77 0.82 0.79 0.84 0.87
CD9_HUMAN P21926 0.90 0.72 0.77 0.82 0.81 0.88 0.86
CEK2_CHICK P18460 0.62 0.64 0.43 0.84 0.67 0.49 0.55
CO02_HUMAN P19075 0.86 0.74 0.82 0.84 0.75 0.82 0.80
COX2_PARDE P08306 0.65 0.61 0.43 0.70 0.60 0.61 0.61
COX3_PARDE P06030 0.50 0.56 0.56 0.51 0.54 0.56 0.58
CX1B_PARDE P98002 0.60 0.63 0.52 0.60 0.69 0.65 0.66
CXB1_HUMAN P08034 0.78 0.79 0.92 0.73 0.82 0.75 0.84
CXB1_RAT P08033 0.78 0.79 0.92 0.73 0.82 0.75 0.84
CXB1_XENLA P08983 0.79 0.78 0.91 0.74 0.76 0.72 0.84
CYDA_ECOLI P11026 0.70 0.67 0.70 0.77 0.74 0.76 0.74
CYDB_ECOLI P11027 0.81 0.82 0.78 0.79 0.81 0.85 0.85
CYOA_ECOLI P18400 0.63 0.64 0.59 0.58 0.53 0.53 0.57
CYOB_ECOLI P18401 0.68 0.59 0.70 0.60 0.77 0.55 0.67
CYOC_ECOLI P18402 0.61 0.53 0.67 0.69 0.78 0.68 0.71
CYOD_ECOLI P18403 0.85 0.89 0.75 0.56 0.81 0.89 0.82
CYOE_ECOLI P18404 0.53 0.34 0.37 -0.01 0.36 0.30 0.38
DHG_ECOLI P15877 0.81 0.68 0.67 0.79 0.88 0.71 0.83
DMSC_ECOLI P18777 0.72 0.81 0.72 0.57 0.74 0.72 0.78
DSBB_ECOLI P30018 0.70 0.64 0.64 0.61 0.31 0.89 0.65
EDG1_HUMAN P21453 0.74 0.69 0.83 0.76 0.71 0.92 0.86
EGFR_CHICK P13387 0.39 0.55 0.54 0.71 0.54 0.55 0.56
EGFR_HUMAN P00533 0.44 0.91 0.46 0.88 0.72 0.45 0.52
ENVZ_ECOLI P02933 0.77 0.95 0.96 0.87 0.72 0.93 0.90
EXBB_ECOLI P18783 0.79 0.76 0.89 0.79 0.75 0.90 0.81
EXBD_ECOLI P18784 0.85 1.00 0.91 0.81 0.75 0.91 0.91
FCE2_HUMAN P06734 0.98 0.91 0.89 0.82 0.94 0.89 0.91
FTSH_ECOLI P28691 0.85 0.89 0.75 0.00 0.92 0.87 0.93
FTSL_ECOLI P22187 0.94 1.00 0.97 0.94 0.81 0.94 1.00
FUCP_ECOLI P11551 0.60 0.76 0.90 0.64 0.68 0.69 0.88
GAA1_CHICK P19150 0.76 0.91 0.78 0.91 0.64 0.79 0.81
GAA1_HUMAN P14867 0.76 0.92 0.79 0.91 0.65 0.74 0.82
GAA2_HUMAN P47869 0.66 0.86 0.87 0.85 0.41 0.66 0.77
GAA3_HUMAN P34903 0.73 0.92 0.70 0.89 0.64 0.75 0.82
GAA4_BOVIN P20237 0.69 0.82 0.80 0.77 0.44 0.73 0.80
GAA5_HUMAN P31644 0.69 0.93 0.78 0.90 0.46 0.71 0.79
GAA6_MOUSE P16305 0.72 0.92 0.68 0.89 0.43 0.78 0.80
GAB1_HUMAN P18505 0.71 0.46 0.79 0.89 0.20 0.77 0.78
GAB2_HUMAN P47870 0.71 0.34 0.79 0.89 0.61 0.83 0.79
GAB3_HUMAN P28472 0.69 0.34 0.79 0.89 0.41 0.72 0.77
GAB4_CHICK P24045 0.73 0.47 0.80 0.90 0.43 0.74 0.79
GAB_LYMST P26714 0.65 0.58 0.72 0.88 0.46 0.82 0.78
GAC1_RAT P23574 0.63 0.54 0.79 0.91 0.66 0.78 0.82
GAC3_MOUSE P27681 0.61 0.54 0.90 0.88 0.70 0.75 0.80
GAC4_CHICK P34904 0.69 0.58 0.67 0.88 0.62 0.73 0.75
GAD_MOUSE P22933 0.57 0.73 0.65 0.88 0.62 0.60 0.69
GAR1_HUMAN P24046 0.75 0.61 0.78 0.88 0.63 0.76 0.80
GAR2_HUMAN P28476 0.74 0.70 0.78 0.88 0.43 0.77 0.79
GLPA_HUMAN P02724 0.73 0.53 0.60 0.89 0.65 0.68 0.68
GLPC_HUMAN P04921 0.89 0.97 0.92 0.84 0.92 0.97 0.97
GLPT_ECOLI P08194 0.67 0.80 0.86 0.65 0.68 0.74 0.85
GLP_PIG P02725 0.97 0.92 0.95 0.89 0.97 0.92 0.97
GMCR_HUMAN P15509 0.81 0.87 0.60 0.89 0.61 0.63 0.69
GPT_CRILO P23338 0.69 0.68 0.89 0.67 0.80 0.78 0.91
GRA1_HUMAN P23415 0.64 0.77 0.73 0.85 0.49 0.46 0.71
GRA2_HUMAN P23416 0.67 0.77 0.73 0.83 0.67 0.56 0.76
GRA3_RAT P24524 0.66 0.61 0.66 0.84 0.63 0.49 0.70
GRB_RAT P20781 0.57 0.66 0.75 0.82 0.75 0.68 0.77
HEMA_CDVO P24306 0.48 0.92 0.50 0.87 0.86 0.40 0.62
HEMA_MEASI P26028 0.69 0.96 0.43 0.86 0.40 0.63 0.84
HEMA_PI4HA P21526 0.60 0.97 0.68 0.95 0.93 0.64 0.76
HG2A_HUMAN P04233 0.58 0.87 0.45 0.82 0.85 1.00 0.89
HISM_SALTY P02912 0.60 0.63 0.57 0.61 0.54 0.48 0.61
HISQ_SALTY P02913 0.69 0.60 0.61 0.54 0.52 0.67 0.67
HOXN_ALCEU P23516 0.53 0.41 0.52 0.61 0.49 0.58 0.56
IG1R_HUMAN P08069 0.40 0.98 0.53 0.86 0.62 0.57 0.66
IL2A_HUMAN P01589 0.60 1.00 0.64 0.91 0.62 0.68 0.68
IL2B_HUMAN P14784 0.57 0.59 0.36 0.84 0.53 0.60 0.59
IM23_SCHJA P27591 0.85 0.80 0.81 0.83 0.89 0.93 0.90
IM23_SCHMA P19331 0.87 0.88 0.81 0.83 0.89 0.89 0.90
IMM1_ECOLI P02985 0.76 0.59 0.90 0.86 0.68 0.79 0.86
IMMA_CITFR P05701 0.81 0.69 0.83 0.78 0.82 0.82 0.83
ITA5_MOUSE P11688 0.64 0.85 0.34 0.85 0.94 0.36 0.67
KDPD_ECOLI P21865 0.77 0.97 0.80 0.89 0.87 0.69 0.95
KGTP_ECOLI P17448 0.64 0.73 0.77 0.69 0.62 0.70 0.76
LACY_ECOLI P02920 0.64 0.70 0.73 0.65 0.75 0.72 0.82
LECH_HUMAN P07306 0.89 0.95 1.00 0.89 0.92 0.89 0.95
LECI_MOUSE P24721 0.81 0.95 0.68 0.87 0.95 0.95 0.98
LEP_ECOLI P00803 0.69 0.85 0.69 0.78 0.84 0.66 0.74
LHA4_RHOAC P26789 0.83 0.29 0.84 0.85 0.85 1.00 0.89
LHB5_RHOAC P26790 0.67 0.00 0.41 0.58 0.80 0.47 0.58
LSPA_ECOLI P00804 0.70 0.83 0.77 0.71 0.71 0.80 0.78
MAGL_MOUSE P20917 0.49 0.92 0.48 0.84 0.61 0.48 0.61
MALF_ECOLI P02916 0.81 0.89 0.80 0.84 0.80 0.80 0.86
MALG_ECOLI P07622 0.70 0.71 0.71 0.79 0.71 0.73 0.76
MELB_ECOLI P02921 0.57 0.75 0.72 0.75 0.61 0.69 0.74
MOTA_ECOLI P09348 0.68 0.57 0.91 0.75 0.57 0.88 0.88
MOTB_ECOLI P09349 0.62 0.87 0.83 0.90 0.83 0.84 0.87
MPRD_HUMAN P20645 0.77 0.86 0.60 0.93 0.65 0.56 0.67
MTR_ECOLI P22306 0.65 0.56 0.72 0.68 0.51 0.58 0.73
MYP0_HUMAN P25189 0.67 0.58 0.58 0.65 0.62 0.65 0.65
NEP_HUMAN P08473 0.70 0.88 0.66 0.88 0.96 0.95 0.98
NGFR_HUMAN P08138 0.56 0.93 0.53 0.90 0.54 0.56 0.58
OPPB_SALTY P08005 0.83 0.85 0.95 0.81 0.67 0.84 0.91
OPPC_SALTY P08006 0.75 0.80 0.80 0.81 0.79 0.82 0.88
OPS1_CALVI P22269 0.62 0.64 0.60 0.83 0.65 0.90 0.79
OPS2_DROME P08099 0.73 0.64 0.78 0.84 0.74 0.91 0.87
OPS3_DROME P04950 0.65 0.61 0.69 0.82 0.69 0.85 0.82
OPS4_DROME P08255 0.71 0.61 0.69 0.84 0.73 0.89 0.86
OPSB_HUMAN P03999 0.75 0.72 0.83 0.81 0.75 0.91 0.88
OPSD_BOVIN P02699 0.73 0.68 0.77 0.84 0.61 0.86 0.93
OPSG_HUMAN P04001 0.72 0.65 0.69 0.80 0.68 0.92 0.87
OPSR_HUMAN P04000 0.70 0.66 0.67 0.80 0.81 0.88 0.90
PHOR_ECOLI P08400 0.78 0.58 0.54 0.78 0.58 0.64 0.66
PIGR_HUMAN P01833 0.53 0.98 0.53 0.88 0.72 0.51 0.63
RFBP_SALTY P26406 0.88 0.87 0.81 0.75 0.81 0.89 0.86
RHAT_ECOLI P27125 0.61 0.82 0.87 0.62 0.67 0.76 0.78
RIB1_RAT P07153 0.66 1.00 0.64 1.00 0.66 0.67 0.70
SECD_ECOLI P19673 0.78 0.76 0.70 0.70 0.65 0.69 0.82
SECE_ECOLI P16920 0.64 0.97 0.90 0.56 0.67 0.92 0.83
SECY_BASCU P16336 0.67 0.75 0.81 0.83 0.72 0.87 0.83
SECY_ECOLI P03844 0.79 0.83 0.78 0.84 0.73 0.82 0.86
SSRG_RAT Q08013 0.82 0.72 0.89 0.72 0.52 0.79 0.84
SUIS_HUMAN P14410 0.40 0.69 0.36 0.89 0.93 0.38 0.55
TAL6_HUMAN P30408 0.80 0.88 0.84 0.82 0.82 0.92 0.91
TCB1_RABIT P06333 0.60 0.92 0.59 0.85 0.88 0.95 0.95
TCR1_ECOLI P02982 0.44 0.84 0.74 0.56 0.66 0.60 0.81
TOLQ_ECOLI P05828 0.81 0.69 0.70 0.74 0.81 0.70 0.76
TOLR_ECOLI P05829 0.90 0.80 0.74 0.85 0.90 0.80 0.88
TRBM_HUMAN P07204 0.48 0.91 0.33 0.89 0.59 0.33 0.50
TRSR_HUMAN P02786 0.48 0.54 0.49 0.83 0.94 0.41 0.64
UHPT_ECOLI P13408 0.65 0.82 0.67 0.67 0.55 0.62 0.78
UPKB_BOVIN P38573 0.88 0.92 0.85 0.85 0.86 0.89 0.91
VMT2_IAANN P21430 0.73 0.93 0.91 0.73 0.61 0.79 0.79
VNB_INBBE P27908 0.83 0.94 0.97 0.88 0.91 0.94 0.97
C-average0.71 0.75 0.720.780.710.75 0.79